2022 05-03 如何一键查询学术大咖的学术地位? 首先我们百度百科一下,什么是H-index:h-index ,又称为h指数或h因子(h-factor),是一种评价学术成就的新方法。h代表“高引用次数”(high citations),一名科研人员的h指数是指他至多有h篇论文分别被引用了至少h次。h指数能够比较准确地反映一个人的学术成就。一个人的h指数越高,则表明他的论文影响力越大。例如,某人的h指数是20,这表示他已发表的论文中,每篇被引用了至... 阅 读 全 部 >
2022 05-03 一款用于基因表达分析、功能更为强大的eFP‐Seq Browser工具 新一代测序技术的发展使测序成本大为降低,测序数据也呈现爆炸式的增长。其中,转录组数据RNA-seq最受研究人员欢迎。通过分析感兴趣的器官/组织/细胞中的基因表达模式,研究人员可以更好地了解基因在不同发育时期、不同环境或是处理条件下表达水平的变化,从而进一步分析基因功能。处理大型RNA-seq数据集的工具eFP‐Seq Browser实现了用户友好的基因表达分析和可视化。说起可视化工具,大家最熟悉的... 阅 读 全 部 >
2022 05-03 Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这 编译 |生信宝典,May校对 |生信宝典生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础 、 高颜值在线绘图和分析 、转录组分析 ( Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这 )、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程 )、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 )、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医...阅读... 阅 读 全 部 >
2022 05-03 什么是Linux进程?该如何用命令管理Linux进程? 在这篇指南中,我们会逐步对进程做基本的了解,然后简要看看如何用特定命令管理Linux进程。进程process是指正在执行的程序;是程序正在运行的一个实例。它由程序指令,和从文件、其它程序中读取的数据或系统用户的输入组成。进程的类型在Linux中主要有两种类型的进程:前台进程(也称为交互式进程)–这些进程由终端会话初始化和控制。换句话说,需要有一个连接到系统中的用...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022 05-03 这些 Linux 技巧会大大提高你的工作效率! 前言Linux中的一些小技巧可以大大提高你的工作效率,本文就细数那些提高效率或者简单却有效的linux技巧。命令编辑及光标移动这里有很多快捷键可以帮我们修正自己的命令。接下来使用光标二字代替光标的位置。删除从开头到光标处的命令文本ctrl + u,例如:$ cd/proc/tty; ls-al光标如果此时使用ctrl + u快捷键,那么该条命令都会被清除,而不需要长按backspace键。删除从.... 阅 读 全 部 >
2022 05-02 三招快速搞定 Linux 文件批量重命名! 在我们的工作生活中,不管是程序员还是非程序员,都会遇到一个需求,那就是对一堆文件进行重命名。在 Windows 下有很多优秀的软件可以帮助我们完成这个需求,而在 Linux 环境下,我们可以简单敲一些代码就可以完成这个需求。本文将介绍三种最基本的文件重命名方法,因为比较基础,所以老司机可以到此为止。rename 命令顾名思义,rename 命令就是用来进行重命名文件名的。rename 命令有非常强... 阅 读 全 部 >
2022 05-02 在 Linux 上复制和重命名文件 cp 和 mv 之外,在 Linux 上有更多的复制和重命名文件的命令。试试这些命令或许会惊艳到你,并能节省一些时间。Linux 用户数十年来一直在使用简单的 cp 和 mv 命令来复制和重命名文件。这些命令是我们大多数人首先学到的,每天可能有数百万人在使用它们。但是还有其他技术、方便的方法和另外的命令,这些提供了一些独特的选项。首先,我们来思考为什么你想要复制一个文件。你可能需要...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022 05-02 分析数据时你可能遇到一些奇奇怪怪的符号…… 在分析数据的时候,不管是数据表格中还是脚本中经常会出现一些奇奇怪怪的符号。这些符号中有些符号用法简单,而另一些符号功能特别强大。下面就以R语言为例,为大家整理一下常见符号的功能用法。NaN“Not a Number”的缩写,非数值,NaN参与运算时返回NaN。a <- 0/0a#[1] NaNa+1#[1] NaNNA“Not available”的缩写...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022 05-02 图形解读系列 | 散点图也不简单 识图:先理解 每个点是什么 (点代表基因、样品、通路或其它的,这个认识可以来自于常识,来自于自己对数据的认识,或来自于文章作者的描述),然后看 横轴代表什么 、 纵轴代表什么 ,再看图例中展示的其他信息如颜色、大小和形状分别代表什么。这些都理顺了,图理解就不难了。来源:https://www.r-graph-gallery.com/272-basic-scatterpl...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022 05-02 在Amazon Web Services中使用R语言运行模拟 原文链接:http://tecdat.cn/?p=6339我最近一直做R中的一些模拟研究,涉及计算机密集型MCMC采样。通常我会使用我所在机构的计算集群来做这些,利用大量的计算机核心,但暂时缺乏这种可用性导致我调查使用亚马逊的Web服务(AWS)系统。在这篇文章中,我将描述我在R中进行模拟的步骤。使用Amazon Web Services进行初始设置首先注册ht...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >