分类目录归档：学习课程

2022
08-06

转座的“移花接木”之功-Tn5、ATAC-Seq、LIANTI、单细胞

高通量测序（NGS）技术的发展以及实验通量的不断增加，要求NGS上游样本处理步骤尽可能简便，以提高NGS整个流程的工作效率。转座系统具有快速“剪切、粘贴”、“复制、粘贴”的功能，已被创新应用于NGS领域，如ATAC-Seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing，利用高通量测序检测转座酶易接... 阅 读 全 部 >
2022
07-10

靶向RNA-seq全面解决方案和加速分析，只看这篇就够了！

背景RNA-seq，即通过高通量测序技术进行的转录组测序分析技术。最初作为研究mRNA，small RNA，non-coding RNA 等表达水平、表达差异基因的应用，在过去的十几年内迅速发展。而今， RNA-seq 在转录本变异、基因融合、可变剪切检测等场景均有大规模的应用。靶向 RNA-seq 则是对特定的转录本进行重点分析，与标准RNA-seq 类似，靶向富集方法可用于评...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
2022
07-09

快速识别异常值，你可能需要箱线图分析

当你在做数据总结分析，或者科研调查分析，甚至季度年度总结汇报，需要查看数据的分布情况以及是否有异常情况来形成结论辅助进一步分析时，那么哪种图表能够清晰直观地展现出这一信息呢？答案只有一个，那就是...箱线图！什么是箱线图箱线图，又名为盒须图，盒式图，通常用于展示一组数据的分布情况，因为主题形状像一个箱子，所以得名箱线图。它主要用于反映原始数据分布的特征，还可以进行多组数据...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2022
06-28

RStudio|用R Markdown生成你的R语言数据分析报告

R Markadown 作为一款通过R语言创建动态文档的写作排版工具，为数据科学提供了现成的写作框架。通过 R Markdown 不仅可以运行和保存R代码，还可以生成高质量的数据分析报告并以HTML、PDF或者word的形式分享。1，get started很早就对R语言可以制作高质量的报告有所耳闻，但也没有很强的意愿去研究一番。究其缘由在于写公众号时无法不会优雅的插入代码块，便有意...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022
06-28

用Rmarkdown写毕业论文

博士生涯终于走到了最后一步了。这次全程用 R 和 Rmarkdown 相关的包完整写完了论文，现在总结一下个人经验和踩过的坑，希望给后来人提供参考经验，同时安利一下 Rmarkdown 这个提高生产力的工具。选择 Rmarkdown 的理由大部分大学的毕业论文对排版都着严格的排版要求，具体需要注意的细节可能有图表要编号，并经常需要在文中交叉引用引...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
06-23

R语言高效的管道操作magrittr

作者：张丹，R语言中文社区专栏特邀作者，《R的极客理想》系列图书作者，民生银行大数据中心数据分析师，前况客创始人兼CTO。个人博客 http://fens.me， Alexa全球排名70k。前言使用R语言进行数据处理是非常方便的，几行代码就可以完成很复杂的操作。但是，对于数据的连续处理，还是有人觉得代码不好看，要么是长长的函数嵌套调用，有点像Lisp感觉，括号包一切；要么就是每次操作赋值...阅读... 阅 读 全 部 >
2022
06-23

R语言爬虫系列5|正则表达式与字符串处理函数

作者：鲁伟，热爱数据，坚信数据技术和代码改变世界。R语言和Python的忠实拥趸，为成为一名未来的数据科学家而奋斗终生。个人公众号：数据科学家养成记 （微信ID：louwill12）第三篇戳：R语言爬虫系列3|HTTP协议无论是R中的RCurl组件还是Python的BeautifulSoup库，对网页HTML完成下载解析之后我们从这些看似杂乱无章的文本中拿到我们感兴趣的数据。之前在系列2的时候小编... 阅 读 全 部 >
2022
06-21

R语言中列表的创建与使用

R语言中的列表与R语言中的向量、数组和矩阵不同，它的每个分量的数据类型可以是不同的。列表是对象的集合，可以包含向量、矩阵、数组，数据框，甚至是另外一个列表，且在列表中要求每一个成分都要有一个名称。列表中的对象又称为它的分量（components）。创建列表在R语言中可以使用list()函数来创建列表，其语法格式为：list(name1=object1, name...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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