分类目录归档：科研&学习

2022
06-12

用R语言把数据玩出花样

作者：张丹，R语言中文社区专栏特邀作者，《R的极客理想》系列图书作者，民生银行大数据中心数据分析师，前况客创始人兼CTO。个人博客 http://fens.me， Alexa全球排名70k。前言作为数据分析师，每天都有大量的数据需要处理，我们会根据业务的要求做各种复杂的报表，包括了分组、排序、过滤、转置、差分、填充、移动、合并、分裂、分布、去重、找重、填充 等等的操作。有时为了计算一个业...阅读... 阅 读 全 部 >
2022
06-10

比较转录组≠无参转录组的比较

派森诺转录组致力于科技服务的产品丰富且专业，产品在丰富的同时也有细致划分。今天带大家来了解一下对于无参考基因组的物种，比较转录组和无参转录组的区别。区别：1、分析目的不同：无参转录组测序：利用高通量测序技术进行cDNA测序，全面快速地获取某一种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。根据将不同组的unigene进行比较，得到差异基因进行分析。比较转录组测序：是基于高通...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2022
06-07

表观遗传，一场环境对基因的逆袭

转载请注明：解螺旋·临床医生科研成长平台10余年前，华盛顿大学的生物学教授Michael Skinner的团队做过一系列有意思的实验。2005年，他们将怀孕的女大鼠（F0）暴露于一种农业中常用的杀真菌剂，乙烯菌核利。接着在无杀菌剂的环境中将她们的后代拉扯大，一直养了4代，也就是养到了她们的玄孙（F4）。结果几乎所有玄孙子的精子数量、繁殖能力都有下降，并且出现了年龄相关的不育症。在所...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022
06-07

当我们在讨论表观遗传的遗传时，我们究竟在讨论什么？

本文根据 2016 年 8 月清华大学颉伟研究员在复旦大学「表观基因组学暑期国际讲习班」中的报告整理而成，本文采用第一人称叙述，文中的“我”皆指颉伟研究员。报告原视频详见：系列视频5 | 清华颉伟：表观遗传的遗传与重编程，视频全长约 2h30min，文字约 2 万字（不含提问）。且听颉伟教授由浅入深，娓娓道来。本文正确打开方式：阅读 2 万字长文确实需要花点时间，不过本文语言通俗，逻辑严密...阅... 阅 读 全 部 >
2022
06-06

转录组和蛋白质组整合研究

发现与细胞状态相关的基因表达特征是分子生物学研究的重要方向。对于细胞在分子层面的差异，可能表现为跨多个维度，如基因组变异、基因表达、蛋白质翻译和翻译后修饰（PTM）。这些不同维度之间的变化是动态的，单独分析某特定维度可能会丢失很多信息，这就需要对这类多层信息进行综合分析，以了解生物系统各个组成部分之间的相互作用。近年来，高通量RNA测序和质谱技术在转录和蛋白质方面的最新进展使其成为...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022
06-05

一文看懂表观遗传学

表观遗传学作为近10年来炙手可热的方向，其研究已经深入到各个学科和领域，促进了医学，动物学，植物学，生殖发育等学科的发展，在疾病机制，诊断治疗，动植物性状改良等方面均获得了令人瞩目的成就和显著的突破。虽然全世界表观遗传学研究的如火如荼。但是，很多实验室仍不清楚表观遗传学到底是神马东西？总是听到很多老师和我们咨询，希望自己的课题能向前沿的方向靠拢，但总感觉隔着一层纱，感觉有些“高大上”，虽然很多文章... 阅 读 全 部 >
2022
06-05

收下这6个免费、无版权的图标网，不缺高级感！

无版权图标网站1：easyicon.neteasyicon 是一个非常大众的图标网站，图库非常全。图标网采用的是中文搜索，响应速度相对于其他网站来说很快。网站设计非常简洁，打开就是一个搜索框，直接输入你需要的关键词，就可以搜索出大量图标，尺寸从大到小排列提供下载。不过要提醒大家的是，下载图片的时候，要注意右侧的版权信息，只有标注了C reative Commons Attribution-Shar... 阅 读 全 部 >
2022
06-04

30天学会R DAY4： R语言对象（2）：数据框和列表及其操作

R语言主要分析的对象是数据集，R语言数据集类型主要是向量、矩阵、数据框、列表、数组等，我们主要介绍前4种。上一推文我们介绍了向量和矩阵，本文介绍数据框和列表。一、数据框（Data.frame）数据框是医学研究最重要的、也是最主要的格式，常见的医学数据导入到R语言形成的就是数据框。R语言中做统计分析的样本数据，都是基于数据框类型操作的。数据框的每一列代表一个变量属性的所有取值，每一行...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
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